一、投資未上市(櫃)公司股票易有「交易安全性」的問題：由於未上市 (櫃)公司大多不會委託專業的股務代理機構，為其辦理股務事宜，且股票也沒有送存集中保管，因此，在未上市(櫃)公司股票欠缺集中交易市場，僅能透過私人間買賣的情形下，投資人有可能買到偽造的股票而不自知，或者在股票交割作業上遭遇困難。因此，只要是遇到不肖分子假借募資之名詐騙，投資人極容易血本無歸。
二、資訊透明度不足：由於上市(櫃)公司於掛牌時，均需與證券交易所或櫃買中心簽訂使用市場契約，並受主管機關監督及各種法令的約束，因此，上市(櫃)公司內外部查核及資訊公開機制較為嚴謹，且年度財務報告須經會計師查核，季財務報告則須會計師核閱，再經過證交所「公開資訊觀測站」揭露，投資人可獲得的資訊較多。
因此，投資人保護中心提醒，未上市(櫃)公司除屬「公開發行公司」可取得較多的資訊外，未公開發行的公司因較欠缺相關單位監督，所以在資訊透明度上與上市 (櫃)公司差距甚大，投資人無法及時掌握公司相關狀況。
三、流動性低：未上市(櫃)公司股票欠缺公開交易市場，當投資人想收回其投入的資金時，無法如上市(櫃)公司的股票一樣於集中市場迅速脫手，且還需自行尋找買方，投資人無法靈活運用其資產。
投資人保護中心更提醒，若投資人一定要投資未上市(櫃)股票，至少要對該公司財務、業務狀況有所瞭解，且在買賣時，務必要簽訂書面契約，並確認股票是否順利過戶，進而減少可能發生的交易糾紛。